退伍軍人症是一種叫Legionella pneumophila細菌所引起的肺炎症狀，起初因美國退伍軍人在1976年聚會時，造成34名退伍軍人死亡而聞名。因為冷卻水塔是這種細菌的最佳繁殖場所，所以冷卻水塔必須檢測有無這種細菌，發現有的時候，冷卻水塔就必須添加對退伍軍人症有效的殺菌劑。

(1) 微生物和粘泥會阻塞水管，降低水流。
(2) 微生物和粘泥會造成熱傳障礙，造成生產瓶頸；也會造成冷卻水塔散水材堵塞，導致冷卻水溫度無法降低。
(3) 有一些微生物本身會造成腐蝕問題(例如：鐵細菌和硫酸根還原菌)，微生物粘泥會造成沈積物下方的腐蝕。
(4) 會加速水垢沈積物的生成。

冷卻水常發生的腐蝕有：均勻腐蝕、點蝕（Pitting）、流電腐蝕（Galvanic corrosion）、流蝕（Erosion）、沈積物下方腐蝕（Underdeposit corrosion）、摩擦腐蝕、疲勞腐蝕等。

(1)補給水先經過軟化
(2)加酸降低冷卻水的 pH
(3) 補給水預先過濾或冷卻水做旁流過濾
(4)降低濃縮倍數
(5)添加分散劑抑制水垢沉積
(6)利用旁流過濾器(Side stream filter)降低S.S.
(7)利用Air Bumping 或 Back Wash降低熱交換器沈積物

(1)水質：冷卻水形成沈積問題的主要因素有pH、形成結垢物質的溶解形態及數量、懸浮物狀態及含量、濃縮倍數等等。
(2)溫度：溫度影響結垢及沈積至鉅，溶解度隨溫度升高而降低的物質容易在高溫部位沈積。
(3)流速：殼側冷卻設備通常流速較低，流速低於每秒一呎時，由於懸浮物沈降，容易造成污塞問題。熱交換器冷卻水設計流速通常為3~8呎/秒。
(4)微生物滋長：微生物控制不良易造成黏泥污塞問題。
(5)腐蝕：金屬腐蝕所形成的大量化產物，非但加速腐蝕，也產生沈積問題，干擾熱傳導率。必須留意腐蝕抑制方案的效果。
(6)製程污染：製程洩漏可能導致無機鹽析出或有機物附著。油脂物質附著熱交換表面，會形成油膜，妨礙熱傳導，且黏著其他物質，更加劇沈積問題。

從下表的數據，即可了解。

(1)Scaling是化學物質過飽合，所造成的結晶性水垢，一般較為堅硬，其水垢分析結果有固定的化學組成。 
(2)Fouling是由各種懸浮雜質(SS)沈澱而成，一般較為鬆軟，其水垢分析結果沒有固定的化學組成。

一般常見的水垢沈積物有:碳酸鈣、碳酸鎂、氫氧化鎂、硫酸鈣、矽酸鈉、矽酸鎂等。

(1)會產生水垢沈積（Scale & fouling），造成熱傳障礙和生產瓶頸。

(2)會產生腐蝕（Corrosion）問題，導致生產設備損壞、增加維修和設備壽命提前結束，並造成系統氧化鐵沈積，進而加速並惡化水垢沈積。

(3)會產生微生物大量滋長，導致微生物及其粘泥（slime）堵塞系統、阻礙水流，造成熱傳障礙，並導致水垢和腐蝕問題惡化。